Fasta Ya !!!

Un fichero .fasta es un archivo de texto diseñado para almacenar información genética.

La forma en la que se escribe el archivo tiene una estructura particular, diseñada para ser explorado rápidamente usando los métodos adecuados.

Digamos que cada “párrafo” del fichero contiene una secuencia mas o menos larga de letras con una parte de la información genética de una célula. Los trozos de información se separan con un tipo de linea diferente que empieza con el símbolo > seguido de un nombre o identificador del “párrafo”.

El trabajo de muchos investigadores es explorar estos ficheros buscando los genes mutados que causan las enfermedades. Así escrito quizás no quede del todo claro pero estoy seguro que el siguiente ejemplo práctico permitirá al lector bloguero comprender a que nos referimos.

¿Podrías encontrar el gen mutilado... digo el gen mutado en el siguiente fichero Fasta?

>read number 1

G C A T A A G C C A G G C G C C A C G C C T T G A C T A T A

A C C I P F G T G T C G T A T T A C A A C C G A C C A T G G

G C A T A A G C C A G G C G C C A C G C C T T G A C T A T A

C T T G T A C C T A T T G A A G A C T T A C G T A G C T T A

>read number 2

T A A A T T C A T C C T C A T T T C A C G G A G T G C T A A

C C G T T C A A T A T A C C C C I P F C C A A C A G G G C A

G A C G T T T C T C C C C C C T T C G G T A T G C C C G A G

>read number 3

A C T C A C C C G A G G A T C G C T G C G G A C A A T C A G

A T G T C A C I P F A A G G A C A C T G G A A T G A G T T T

…

…

…

>read number 108

T C T G T G C G T T G A T G G G T A T T C T T C A T A T A T

A G A G G G C I P F A G A C T G C C G G A C C A A C A G A T

T C G C C G C T G T G C G G T A G A C T T T A G G T G C T C

G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G

G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G

G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G

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G G G G G G G G G G G G G   n o   t i e n e   g r a c i a